»Die Mysterien des Organismus beginnt als Dokumentarfilm über den Freud-Schüler Wilhelm Reich, der aufgrund seiner oft verrückten, jedoch immer menschlichen Theorien von der kosmischen Rolle der Energie des Orgasmus seinen Lebensabend in einem amerikanischen Gefängnis zubringen mußte. Was dann folgt, ist ein filmisches Rätsel mit vielen Lösungsansätzen: eine Schwarze Komödie, eine Science-Fiction-Groteske, ein Dokumentarfilm, ein „politischer Zirkus“ (Makavejev) oder Makavejevs ganz private Sammlung sexueller und politischer Kindheitstraumata. Variationen über Faschismus und Kommunismus des menschlichen Körpers, eine Information über das politische Leben der Geschlechtsteile des Menschen, Proklamation des pornographischen Charakters eines jeglichen Systems, das mit Autorität und Macht Unterdrückung ausübt.« (Arsenal Berlin)